2004-01-01から1年間の記事一覧

川鍋さん来研

Fraunhofer の川鍋さんが来研。 Non-Gaussian component analysis の話を、 あーこういうことやりたいと思ってたのにーと思いながら聞く。 ちょっと僕には思いつきそうにない巧妙な手法であったが、 実問題ではいまいちうまくいっていないらしい。もし実問題…

みくしぃ

ミクシィからリンクを張ってみた。 ちょうどよい機会なので、研究生活関連の話題はここに書いていくことにする(かもしれない)

Bootstrapping cluster analysis: assessing the reliability of conclusions from microarray experiments.

bio

Proc Natl Acad Sci U S A. 2001 Jul 31;98(16):8961-5. Epub 2001 Jul 24.Kerr MK, Churchill GA.The Jackson Laboratory, Bar Harbor, ME 04609, USA.なかなか文章が格調高いと感じた。とくに discussion の章。内容は ANOVAで求めた background noise を…

線型部分空間同士のなす角度は、singular valuesで計ることができる

ベクトルと線型部分空間がなす角度は、ととがなす角度の最大値である。 線形部分空間と線型部分空間がなす角度は、ととがなす角度の最大値である。 行列,のcolumn vectorsが、それぞれの線型部分空間の直交基底をなしているとき、部分空間同士のなす角度のco…

Linear Dependent Dimensionality Reduction

ただし、Yは観測された行列 XはLow Rank Reduction() Z はノイズ。 普通のPCAではZとして全成分でindependentなガウスノイズを仮定しているが、 このNIPS論文では、Zとして非ガウス、非加法的ノイズを仮定しても大丈夫な方法を検討している。 そのためのキー…

論文英語ボキャブラリー増加法

論文を読む。 イイ表現を見つけたら付箋に書き、張る。 その表現を自分の論文に使う機会があったら、そのときに剥して捨てる。(この時点でその表現を自分のものにしたことになる)

False Discovery Rate (FDR)

http://www.google.com/search?hl=ja&q=false+discovery+rate+permutation 多重性の問題はだいたい片が付いているようだな。

ゲノム情報研究と医療のパイプ役…東大大学院に新専攻

http://www.yomiuri.co.jp/science/news/20040125i501.htm

感知:感覚運動学習におけるベイズ予測

Bayesian integration in sensorimotor learning Konrad P. Kording and Daniel M. Wolpert Nature 427, 244- 247(2004) http://www.nature.com/nlink/v427/n6971/abs/nature02169_fs.html

SAM: Significance Analysis of Microarrays

Tibshirani and Chu (2001): "Significance analysis of microarrays applied to the ionizing radiation response" (ps file). (pdf version). PNAS 2001 98: 5116-5121, (Apr 24) http://www-stat.stanford.edu/~tibs/SAM/ http://www-stat.stanford.edu/~…

癌関連遺伝子データベース

Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematologyhttp://www.infobiogen.fr/services/chromcancer/

NCA

Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Dec 23;100(26):15522-7. Epub 2003 Dec 12. Network component analysis: Reconstruction of regulatory signals in biological systems.Liao JC, Boscolo R, Yang YL, Tran LM, Sabatti C, Roychowdhury VP.http://www.pna…